A ridosso di questo altare maggiore un grande vano è destinato pel Coro, ora privo degli stalli. Ed erano assai pregevoli quelli stalli di noce massiccia, finamente intarsiati. Discacciati i Benedettini Cassinesi da quella Badia, gli stalli del coro vennero da Giuseppe Bonaparte donati al Capitolo Cattedrale di Bisceglie, ... .
In cima al Coro, a ridosso del muro di fondo, si ammira una stupenda e grandiosa Cantoria, che sostiene un organo di grandi proporzioni e di non spregevole struttura. Esso fu costruito nel 1614. Non si conosce l'autore ma sembra che appartenga alla scuola dei Sessa.

Nella zona absidale ... vi era sistemato il bellissimo coro, [trasferito nella cattedrale di Bisceglie nel 1807] ... ora ve n'è uno molto modesto a 26 stalli.
Completa l'abside una barocca cantoria scolpita in legno dorato, i cui stipiti presentano due edicole con le sculture di S. Riccardo e S. Benedetto, datata 1644 [tale data è riportata sull'opera; il Merra e l'Agresti leggevano, erroneamente, 1614].
Dietro la cantoria l'organo di 30 registri, eseguito da Michele Sessa per 760 ducati tra il 1853 e il 1855; le sue canne sono ricoperte da una tela raffigurante S. Maria dei Miracoli con S. Riccardo e S. Agostino.

L'istallazione dell'orchestra dell'organo del 1644, in fondo all'abside del presbiterio, rese necessaria la chiusura di un rosone destinato ad adornare ed illuminare la parte presbiteriale.